MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Runella slithyformis DSM 19594 plasmid pRUNSL04

Total Repeats: 862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015705	ATTG	2	8	26	33	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015705	T	6	6	65	70	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015705	TAC	2	6	150	155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015705	A	6	6	160	165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015705	GCC	2	6	203	208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_015705	AAT	2	6	350	355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215038
7	NC_015705	ATA	2	6	393	398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215038
8	NC_015705	T	7	7	487	493	0 %	100 %	0 %	0 %	338215038
9	NC_015705	TCCGCT	2	12	519	530	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	338215038
10	NC_015705	GT	3	6	536	541	0 %	50 %	50 %	0 %	338215038
11	NC_015705	GTAAAA	2	12	545	556	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	338215038
12	NC_015705	CAA	2	6	635	640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338215038
13	NC_015705	TA	3	6	692	697	50 %	50 %	0 %	0 %	338215038
14	NC_015705	TAA	2	6	760	765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215038
15	NC_015705	TA	3	6	950	955	50 %	50 %	0 %	0 %	338215038
16	NC_015705	A	6	6	977	982	100 %	0 %	0 %	0 %	338215038
17	NC_015705	ACC	2	6	1013	1018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215038
18	NC_015705	T	6	6	1125	1130	0 %	100 %	0 %	0 %	338215038
19	NC_015705	ATA	2	6	1158	1163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215038
20	NC_015705	TCA	2	6	1185	1190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215038
21	NC_015705	TCA	2	6	1236	1241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338215038
22	NC_015705	TTTGG	2	10	1349	1358	0 %	60 %	40 %	0 %	338215038
23	NC_015705	AAT	2	6	1400	1405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215038
24	NC_015705	TTTG	2	8	1446	1453	0 %	75 %	25 %	0 %	338215038
25	NC_015705	T	6	6	1528	1533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015705	GCA	2	6	1567	1572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015705	TCAA	2	8	1574	1581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015705	TCCA	2	8	1606	1613	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015705	AAG	2	6	1638	1643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015705	TTTC	2	8	1696	1703	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015705	A	6	6	1718	1723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015705	GTTT	2	8	1760	1767	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015705	TAATG	2	10	1829	1838	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015705	A	6	6	1885	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015705	GCC	2	6	1893	1898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015705	T	6	6	1958	1963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015705	CGC	2	6	1969	1974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_015705	GTT	2	6	2047	2052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015705	AAT	2	6	2103	2108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338215039
40	NC_015705	G	7	7	2157	2163	0 %	0 %	100 %	0 %	338215039
41	NC_015705	CAG	2	6	2223	2228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215039
42	NC_015705	GCC	2	6	2245	2250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215039
43	NC_015705	GTG	2	6	2251	2256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215039
44	NC_015705	A	7	7	2325	2331	100 %	0 %	0 %	0 %	338215039
45	NC_015705	CGGT	2	8	2349	2356	0 %	25 %	50 %	25 %	338215039
46	NC_015705	GCG	2	6	2396	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215039
47	NC_015705	A	6	6	2417	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	338215039
48	NC_015705	CAG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215039
49	NC_015705	TTC	2	6	2502	2507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338215039
50	NC_015705	GCC	2	6	2656	2661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215039
51	NC_015705	GTTT	2	8	2702	2709	0 %	75 %	25 %	0 %	338215039
52	NC_015705	GCAG	2	8	2723	2730	25 %	0 %	50 %	25 %	338215039
53	NC_015705	GCA	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215039
54	NC_015705	T	6	6	2853	2858	0 %	100 %	0 %	0 %	338215039
55	NC_015705	TTG	2	6	2925	2930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338215040
56	NC_015705	TGA	2	6	2980	2985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215040
57	NC_015705	CAG	2	6	3125	3130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215040
58	NC_015705	TGA	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215040
59	NC_015705	ACG	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215040
60	NC_015705	GTTT	2	8	3186	3193	0 %	75 %	25 %	0 %	338215040
61	NC_015705	ACC	2	6	3241	3246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215040
62	NC_015705	TGC	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338215040
63	NC_015705	A	8	8	3299	3306	100 %	0 %	0 %	0 %	338215040
64	NC_015705	TATT	2	8	3345	3352	25 %	75 %	0 %	0 %	338215040
65	NC_015705	CCA	2	6	3388	3393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215040
66	NC_015705	GGAA	2	8	3472	3479	50 %	0 %	50 %	0 %	338215040
67	NC_015705	TGTAT	2	10	3492	3501	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015705	ATACA	2	10	3522	3531	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_015705	GCA	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338215041
70	NC_015705	TGG	2	6	3601	3606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215041
71	NC_015705	TGG	2	6	3643	3648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338215041
72	NC_015705	CAC	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215041
73	NC_015705	CCG	2	6	3693	3698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215041
74	NC_015705	TTC	2	6	3975	3980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015705	ATC	2	6	4047	4052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015705	AGAAAC	2	12	4060	4071	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_015705	GCG	2	6	4205	4210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015705	CTG	2	6	4247	4252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015705	GCCGAT	2	12	4295	4306	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_015705	T	6	6	4316	4321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015705	GGC	2	6	4334	4339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_015705	GTT	2	6	4390	4395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015705	A	7	7	4441	4447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015705	CGTG	2	8	4453	4460	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_015705	GCT	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015705	TAC	2	6	4527	4532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015705	CTG	2	6	4554	4559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015705	TTTC	2	8	4607	4614	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015705	TCT	2	6	4747	4752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015705	TGA	2	6	4754	4759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015705	GCT	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015705	ATT	2	6	4898	4903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015705	TAG	2	6	4927	4932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015705	TA	3	6	4952	4957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015705	ACA	2	6	4960	4965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015705	A	6	6	4997	5002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015705	TAT	2	6	5084	5089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015705	A	6	6	5094	5099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015705	ATTC	2	8	5112	5119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_015705	AGG	2	6	5149	5154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215042
101	NC_015705	TGA	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215042
102	NC_015705	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338215042
103	NC_015705	CCG	2	6	5351	5356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215042
104	NC_015705	T	6	6	5381	5386	0 %	100 %	0 %	0 %	338215042
105	NC_015705	CCAA	2	8	5411	5418	50 %	0 %	0 %	50 %	338215042
106	NC_015705	CCA	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338215042
107	NC_015705	GCC	2	6	5501	5506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338215042
108	NC_015705	GAT	2	6	5596	5601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215042
109	NC_015705	CGG	2	6	5638	5643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215042
110	NC_015705	GAT	2	6	5660	5665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338215042
111	NC_015705	GGC	2	6	5813	5818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338215043
112	NC_015705	AAAAGA	2	12	5824	5835	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338215043
113	NC_015705	AAGAAA	2	12	5978	5989	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	338215043
114	NC_015705	A	7	7	5987	5993	100 %	0 %	0 %	0 %	338215043
115	NC_015705	GAA	2	6	6020	6025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215043
116	NC_015705	TAAGT	2	10	6040	6049	40 %	40 %	20 %	0 %	338215043
117	NC_015705	AATA	2	8	6051	6058	75 %	25 %	0 %	0 %	338215043
118	NC_015705	TAC	2	6	6184	6189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015705	T	6	6	6193	6198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015705	CAAC	2	8	6199	6206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015705	TAC	2	6	6216	6221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015705	A	6	6	6245	6250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015705	T	6	6	6278	6283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015705	A	6	6	6294	6299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015705	A	7	7	6301	6307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015705	TGT	2	6	6320	6325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015705	AAT	2	6	6330	6335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015705	ACTG	2	8	6373	6380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015705	TAT	2	6	6403	6408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015705	TAC	2	6	6415	6420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015705	TAC	2	6	6436	6441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015705	TAT	2	6	6456	6461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015705	TAC	2	6	6468	6473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015705	TAC	2	6	6489	6494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015705	TAT	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015705	TAC	2	6	6511	6516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015705	TAC	2	6	6590	6595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015705	A	7	7	6621	6627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015705	T	6	6	6642	6647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015705	A	7	7	6707	6713	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
141	NC_015705	AGA	2	6	6733	6738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215044
142	NC_015705	A	6	6	6752	6757	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
143	NC_015705	GAA	2	6	6890	6895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338215044
144	NC_015705	TAAG	2	8	6903	6910	50 %	25 %	25 %	0 %	338215044
145	NC_015705	GGA	2	6	6911	6916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338215044
146	NC_015705	GGAT	2	8	6988	6995	25 %	25 %	50 %	0 %	338215044
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159	NC_015705	A	6	6	7633	7638	100 %	0 %	0 %	0 %	338215044
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167	NC_015705	AGAA	2	8	8013	8020	75 %	0 %	25 %	0 %	338215044
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176	NC_015705	CAT	2	6	8320	8325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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404	NC_015705	GTAAAG	2	12	20672	20683	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_015705	T	6	6	21642	21647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_015705	GTA	2	6	21651	21656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_015705	T	6	6	21983	21988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_015705	CGA	2	6	22018	22023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_015705	ATA	2	6	22071	22076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_015705	T	6	6	22243	22248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_015705	AAAAG	2	10	22350	22359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
445	NC_015705	ATG	2	6	22411	22416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_015705	A	6	6	23370	23375	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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